Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
IGKV4-1P06312 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms