Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLGNO14967 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLGNO14967 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLGNO14967 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CLGNO14967 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLGNO14967 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLGNO14967 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms