Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKP3Q9Y446 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms