Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFT52Q9Y366 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms