Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC4Q9Y296 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms