Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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