Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLRF1Q9NZS2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLRF1Q9NZS2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms