Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EHD3Q9NZN3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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