Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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