Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NIT2Q9NQR4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms