Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HMG20AQ9NP66 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HMG20AQ9NP66 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HMG20AQ9NP66 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HMG20AQ9NP66 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HMG20AQ9NP66 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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