Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms