Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms