Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPATA16Q9BXB7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms