Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLVAPQ9BX97 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLVAPQ9BX97 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms