Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms