Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PMCHL2Q9BQD1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms