Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms