Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD2Q96C19 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms