Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EME1Q96AY2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms