Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms