Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMUB2Q71RG4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms