Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3F3CQ6NXT2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms