Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMBOX1Q6NT76 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms