Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT3Q5FWE3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms