Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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