Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC184Q52MB2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms