Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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