Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM16LQ309B1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms