Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms