Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCK2Q16822 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms