Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPPQ16740 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms