Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF239Q16600 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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