Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SSX1Q16384 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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