Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VPS72Q15906 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VPS72Q15906 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VPS72Q15906 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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VPS72Q15906 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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VPS72Q15906 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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VPS72Q15906 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS72Q15906 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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