Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8Q15843 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEDD8Q15843 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NEDD8Q15843 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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NEDD8Q15843 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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NEDD8Q15843 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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