Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NPTX1Q15818 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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