Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EFNB3Q15768 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms