Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms