Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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