Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPIDRQ14159 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms