Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBFBQ13951 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms