Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PKP1Q13835 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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