Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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