Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL1Q13616 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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