Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DNASE1L3Q13609 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms