Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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