Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHIT1Q13231 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHIT1Q13231 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms