Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKAA1Q13131 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKAA1Q13131 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms