Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms